科学研究部(发展规划部、研究生管理办公室)是负责学校科研管理、学科建设和发展规划管理与建设的职能部门，同时承担研究生培养工作、《广州航海学院学报》的编辑和出版。其主要职能有：

一、制订、修订学校科研管理、学科建设的各项制度并实施；

二、制订学校科研发展规划、学科建设规划和年度计划；

三、审定各院（部）的科研工作计划，并督促、检查落实情况，负责各教学单位科研管理考核工作；

四、组织各级各类纵向科研项目的申报、立项与验收工作；

五、负责企事业单位委托的技术开发、技术转让、技术服务、技术咨询等横向项目的管理；

六、组织全校科研成果的评审、鉴定、登记、报奖以及科研成果资料整理、归档和宣传推广等；

七、负责全校知识产权保护和专利管理工作；

八、负责社科、科技统计年报的编制与上报工作；

九、负责学校科技协作和学术活动，以及自然科学、哲学社会科学学会的管理工作；

十、负责学校学术委员会的日常工作；

十一、组织审核高等学校和有关单位的设立、撤销、更名、调整；

十二、承担学校教育事业基本信息的统计、分析及发布工作；

十三、制订学校教育事业发展规划和年度计划；

十四、会同有关部门审核并组织实施学校的年度招生计划；

十五、规划并指导各二级学院学科建设的布局、调整以及高等教育管理体制改革的工作；

十六、负责学科带头人的遴选工作；

十七、负责联合培养研究生工作，以及硕士（博士）点建设工作；

十八、负责挂靠部门（海洋严酷环境材料蚀损过程控制与防护工程技术中心、粤港澳大湾区航运研究院）等的行政管理；

十九、负责《广州航海学院学报》的编辑和出版。